L’area in cui si trovano sia le ville che i giardini è l’antica sede di una delle più sontuose ville romane, l’Albanum Domitiani, realizzata per volere dell’imperatore Domiziano (81-96 d.C.) e destinata a residenza privata di campagna. 

Ancora prima che diventasse dimora estiva per i papi, qui sorse la leggendaria Alba Longa, citata da Tito Livio, Svetonio e Marziale.

In seguito al disfacimento dello Stato Pontificio avvenuto nel 1870, questi luoghi meravigliosi sono rimasti abbandonati per oltre sessant’anni. 

Dal 1932 il Palazzo e le Ville Pontificie hanno subito una radicale trasformazione che le porterà nuovamente ad essere dimora estiva abituale e privilegiata dei papi. 

Nel 2016, per decisione di papa Francesco, il Palazzo Apostolico è stato definitivamente trasformato in museo aperto al pubblico.